التهاب مزمن زمانی رخ می‌دهد که سیستم ایمنی به سلول‌های سالم بدن حمله کرده و سبب بروز بیماری‌های خودایمنی می‌شود. برخی از این بیماری‌ها شامل آرتریت روماتوئید، بیماری کرون و برخی بیماری‌های پوستی مانند پسوریازیس است.